Mancha marron de la hoja
Agente causal: Septoria glycines
Síntomas: Se visualizan principalmente en hojas, manifestando su presencia en los cotiledones y hojas basales. Las manchas foliares comienzan por las hojas inferiores, son angulares a irregulares de color marrón sin protuberancias. Un amarillamiento generalizado acompaña a las hojas afectadas, las cuales caen prematuramente desde la base hacia la parte superior de las plantas.
La Septoria o Mancha Marrón es de la enfermedad de fin de ciclo que puede aparecer más temprano en el lote, aún es estados vegetativos.

Tizón de la hoja y mancha púrpura de la semilla
Agente causal: Cercospora Kikuchii
Síntomas: Puede presentarse en semilla, tallos, hojas y vainas. En las hojas las lesiones son de forma variable, el rasgo típico es de color morado, bronceado a púrpura. Las hojas superiores manifiestan esta característica con mayor intensidad ya que el hongo produce un pigmento tóxico fotoactivo. En vainas se observa un manchado generalizado de color morado. Las infecciones severas pueden causar defoliación o senescencia prematura. En semillas se observa la presencia de manchas de color púrpura y muchas veces, el agrietamiento del tegumento.
Es la enfermedad de mayor cecimiento en los últimos años en el país.
Su esporulación se desarrolla con condiciones de alta humedad relativa y temperaturas medias.

Mancha ojo de rana
Agente causal: Cercospora sojina
Síntomas: Se presentan principalmente en hojas, aunque en menor medida en tallos, vainas y semillas. Consisten en manchas circulares a angulares, en la superficie superior de la hoja, el centro es de color gris ceniza y el borde marrón rojizo, sin halo clorótico.
Las lesiones pueden ser más grandes y las hojas más jóvenes son las más afectadas

Roya asiatica de la Soja
Agente causal: Phakopsora pachyrhizi
Síntomas: Las hojas son los órganos más frecuentemente afectados por esta enfermedad, manifestándose inicialmente por la presencia de diminutas lesiones o manchas, ocultas en las hojas inferiores, puntuales de color grisáceos a amarillento, fundamentalmente en el haz. Luego estos puntos restringidos por las nervaduras, oscurecen más, toman forma poligonal y angular, transformándose en lesiones Necróticas, fácilmente confundibles con las causadas por otras enfermedades (Mancha marrón, tizón, pústula bacteriana).
Si esta enfermedad aparece en estados tempranos (antes de R6), puede causar una severa defoliación, reduciendo fuertemente el rendimiento.

Mancha anillada
Agente causal: Corynespora cassiicola
Síntomas: Afecta todos los órganos de la planta, inclusive raíces, pero su síntoma más evidente se observa en las hojas: lesiones circulares a irregulares de color marrón-rojizo, rodeadas por un halo característico de color amarillo senescente, siempre comparativamente de mayor tamaño en relación al resto de las EFC. Cuando la mancha es grande se observan zonas concéntricas en la misma. Puede causar defoliación.

Mildiú
Agente causal: Peronospora manshurica
Síntomas: Se observa en la cara superior de las hojas áreas irregulares amarillo-verdosas, "tipo lavandina", que luego se necrosan rodeándose de un halo clorótico.
La Septoria o Mancha Marrón es de la enfermedad de fin de ciclo que puede aparecer más temprano en el lote, aún es estados vegetativos.

Phomosis
Agente causal: Phomopsis sojae
Síntomas: los sintomas mas frecuentes son observados en semillas, vainas y tallos. El signo característico es la presencia de picnidios en hileras (se observan como puntuaciones negras), abundantes en el tallo y ramas y dispersos en vainas que bajo condiciones húmedas incrementan su numero. La semillas infectada puede presentarse arrugada y muchas veces por micelo blanco. Sin embargo, puede tener aspecto normal y estar infectada. La mayoría de las veces el síntoma se hace visible a los ojos sobre el final del ciclo del cultivo, cuando ya están seneciendo las hojas.
Phomopsis es uno de los patogenos que más disminuye la calidad de la semilla, generando alta mortandad de plántulas y disminuyendo el poder germinativo.

Antracnosis
Agente causal: Colletotrichum truncatum, Colletotrichum spp
Síntomas: Los síntomas se pueden observar en hojas, tallos, vainas y semillas. Las semillas infectadas pueden ocasionar plántulas enfermas, debilitadas y/o tizón de plántulas. En vainas y tallos se observan parches negros o áreas marrones indefinidas con presencia de acérvulas y peritecios. La presencia de setas en las acérvulas, las distingue de los picnidios de Phomopsis.
Los síntomas foliares (merma de rendimiento) y la infección de semilla (merma de calidad) es mayor con altas temperaturas

Tizon bacteriano
Agente causal: Pseudomonas savastanoi pv.glycinea
Síntomas: Ataca todos los órganos verdes de la planta pero principalmente las hojas. Los síntomas son pequeñas manchas marrón oscuras a negras (carácter distintivo), angulosas, de superficie plana sin protuberancias, generalmente brillantes cuando ocurre el exudado bacteriano (zooglea) mas común en el envés de la hoja.
Las manchas coalescen y el limbo foliar se puede resquebrajar, quedando "agujereado", síntoma comúnmente observable en las hojas superiores mas sometidas al viento.
Las lesiones casi negras, sin elevaciones en el envés, conglomerado, la rotura de la hoja y su aparición desde la parte media del canopeo, la distinguen de la roya asiática.

Pústula Bacteriana
Agente causal: Xanthomonas axonopodis pv. glycines
Síntomas: Se presentan principalmente en hojas, y puede afectar también vainas y semillas. Las lesiones son inicialmente muy pequeñas de color marrón o verde pálido, ligeramente ampollado con un distintivo halo clorótico delgado. Las lesiones pueden coaleser, al igual que el tizón bacteriano, con desprendimiento del tejido foliar. Al realizar una cámara húmeda de las hojas infectadas, se presenta sobre la sintomatología una zooglea característica de la bacteriosis, de aspecto mucoso y brillante. Esta enfermedad no es controlada por fungicidas ya que el agente causal es bacteriano


